Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLT4P35916 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLT4P35916 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLT4P35916 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLT4P35916 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLT4P35916 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLT4P35916 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLT4P35916 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FLT4P35916 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FLT4P35916 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FLT4P35916 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLT4P35916 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLT4P35916 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLT4P35916 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLT4P35916 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLT4P35916 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLT4P35916 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FLT4P35916 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FLT4P35916 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLT4P35916 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms