Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT9P35527 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT9P35527 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT9P35527 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT9P35527 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT9P35527 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT9P35527 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT9P35527 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT9P35527 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT9P35527 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT9P35527 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT9P35527 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT9P35527 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms