Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA1P35221 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA1P35221 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms