Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCD1P33897 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCD1P33897 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCD1P33897 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms