Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA6P31267 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA6P31267 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms