Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPOP30536 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPOP30536 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSPOP30536 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSPOP30536 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSPOP30536 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSPOP30536 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms