Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRABP1P29762 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRABP1P29762 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms