Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1P29120 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK1P29120 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms