Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB2P29033 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB2P29033 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB2P29033 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB2P29033 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB2P29033 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB2P29033 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB2P29033 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB2P29033 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB2P29033 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB2P29033 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB2P29033 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB2P29033 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB2P29033 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB2P29033 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB2P29033 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB2P29033 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB2P29033 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB2P29033 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB2P29033 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB2P29033 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB2P29033 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB2P29033 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB2P29033 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB2P29033 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB2P29033 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB2P29033 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB2P29033 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB2P29033 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB2P29033 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB2P29033 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms