Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMBRP28336 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBRP28336 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBRP28336 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBRP28336 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBRP28336 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBRP28336 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms