Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PDE4AP27815 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4AP27815 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4AP27815 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4AP27815 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4AP27815 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms