Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VARSP26640 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VARSP26640 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VARSP26640 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VARSP26640 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VARSP26640 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VARSP26640 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VARSP26640 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VARSP26640 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VARSP26640 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VARSP26640 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VARSP26640 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VARSP26640 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VARSP26640 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VARSP26640 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms