Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
DNMT1P26358 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
DNMT1P26358 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DNMT1P26358 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms