Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP1P23763 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms