Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPAP23025 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPAP23025 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPAP23025 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPAP23025 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPAP23025 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XPAP23025 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XPAP23025 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XPAP23025 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XPAP23025 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPAP23025 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPAP23025 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPAP23025 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPAP23025 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPAP23025 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPAP23025 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms