Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EPHA1P21709 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EPHA1P21709 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms