Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACO1P21399 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACO1P21399 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACO1P21399 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACO1P21399 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACO1P21399 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms