Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAM1P18669 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms