Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF4P18085 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF4P18085 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF4P18085 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARF4P18085 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARF4P18085 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARF4P18085 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARF4P18085 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARF4P18085 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARF4P18085 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms