Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DESP17661 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DESP17661 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DESP17661 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DESP17661 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DESP17661 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DESP17661 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DESP17661 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms