Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MYOD1P15172 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MYOD1P15172 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYOD1P15172 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYOD1P15172 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms