Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM27P14373 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM27P14373 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms