Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT13P13646 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT13P13646 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT13P13646 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT13P13646 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT13P13646 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT13P13646 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT13P13646 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT13P13646 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT13P13646 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT13P13646 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT13P13646 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms