Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF5P13349 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYF5P13349 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYF5P13349 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYF5P13349 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYF5P13349 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYF5P13349 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYF5P13349 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MYF5P13349 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MYF5P13349 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYF5P13349 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYF5P13349 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYF5P13349 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYF5P13349 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYF5P13349 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms