Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEFHP12036 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFHP12036 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFHP12036 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFHP12036 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFHP12036 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms