Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MS4A1P11836 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MS4A1P11836 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms