Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VDRP11473 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VDRP11473 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VDRP11473 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VDRP11473 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VDRP11473 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VDRP11473 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VDRP11473 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VDRP11473 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VDRP11473 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VDRP11473 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms