Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP1P11387 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TOP1P11387 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP1P11387 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP1P11387 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP1P11387 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP1P11387 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP1P11387 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP1P11387 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1P11387 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1P11387 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1P11387 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1P11387 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP1P11387 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1P11387 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1P11387 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1P11387 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1P11387 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1P11387 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP1P11387 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP1P11387 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms