Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYGBP11216 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYGBP11216 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYGBP11216 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYGBP11216 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYGBP11216 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYGBP11216 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYGBP11216 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PYGBP11216 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PYGBP11216 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms