Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBSLP0DN79 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBSLP0DN79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBSLP0DN79 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms