Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM13P0DJ93 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms