Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms