Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM200BP0CF97 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM200BP0CF97 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms