Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN2P0C2S0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN2P0C2S0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms