Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB7P09629 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXB7P09629 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms