Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL1P09341 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL1P09341 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL1P09341 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL1P09341 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL1P09341 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms