Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LPLP06858 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LPLP06858 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LPLP06858 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LPLP06858 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LPLP06858 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LPLP06858 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms