Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DOAP06340 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms