Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOC1P02654 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOC1P02654 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOC1P02654 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC1P02654 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC1P02654 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC1P02654 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC1P02654 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC1P02654 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC1P02654 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC1P02654 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC1P02654 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms