Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOEP02649 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOEP02649 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOEP02649 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOEP02649 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOEP02649 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOEP02649 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOEP02649 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOEP02649 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOEP02649 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOEP02649 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOEP02649 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOEP02649 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms