Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01737 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01737 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01737 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01737 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01737 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01737 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01737 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01737 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01737 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01737 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms