Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMP1P01033 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMP1P01033 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms