Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P00734 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P00734 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P00734 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F2P00734 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
F2P00734 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P00734 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P00734 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
F2P00734 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
F2P00734 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F2P00734 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F2P00734 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F2P00734 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F2P00734 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P00734 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P00734 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P00734 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P00734 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P00734 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P00734 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P00734 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P00734 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F2P00734 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
F2P00734 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F2P00734 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F2P00734 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms