Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EGFRP00533 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EGFRP00533 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EGFRP00533 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EGFRP00533 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EGFRP00533 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EGFRP00533 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EGFRP00533 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EGFRP00533 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EGFRP00533 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EGFRP00533 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EGFRP00533 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EGFRP00533 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EGFRP00533 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EGFRP00533 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EGFRP00533 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EGFRP00533 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EGFRP00533 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EGFRP00533 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EGFRP00533 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EGFRP00533 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms