Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms