Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms