Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDKL5O76039 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms