Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEDO75530 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEDO75530 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEDO75530 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EEDO75530 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EEDO75530 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EEDO75530 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EEDO75530 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EEDO75530 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEDO75530 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEDO75530 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEDO75530 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEDO75530 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEDO75530 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms