Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TULP3O75386 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TULP3O75386 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TULP3O75386 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TULP3O75386 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TULP3O75386 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP3O75386 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP3O75386 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms