Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA4O75335 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA4O75335 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA4O75335 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms